在明末清初这一动荡时期，中国涌现出了一批杰出的思想家，他们对于传统儒家思想的批判和创新，以及对社会政治的深刻思考，构成了中国古代思想史上的重要篇章。这些思想家的进步思想主要体现在以下几个方面：

1. 反专制集权：针对明朝末年的腐败政治和君主专制的弊端，思想家们提出了限制皇权的理论。例如，黄宗羲在他的《明夷待访录》中提出“天下为主，君为客”的主张，认为人民是国家的主人，而皇帝只是为人民服务的客人，不应享有绝对权力。这种观点在当时具有一定的革命性和前瞻性。

2. 提倡经世致用：与宋明理学注重抽象思辨不同，明清之际的思想家更关注实际问题的解决和社会的现实状况。顾炎武强调“经世致用”的理念，提倡实学和实用知识的学习，鼓励人们深入民间调查研究，以解决社会问题为导向。他的著作《日知录》就体现了这一点。

3. 文化传承与创新：面对传统的束缚和文化危机，王夫之坚持文化的继承和发展是相辅相成的过程。他主张既要尊重传统文化，又要敢于对其进行批判性的吸收和改造。他认为只有不断推陈出新，才能使文化保持生机活力。

4. 科学精神的萌芽：尽管受到时代局限，但一些思想家已经开始表现出对科学的兴趣和对实践经验的重视。徐光启翻译了西方数学名著《几何原本》，并致力于农业技术的改进；李时珍编撰了《本草纲目》，这些都是科学与技术相结合的重要成果。

5. 道德伦理的重塑：在礼崩乐坏的社会背景下，思想家们试图重新构建社会的道德基础。他们倡导个体的修养和自律，强调人的社会责任感和公共精神。这不仅是对儒家伦理的补充和完善，也是对社会秩序的一种维护。

6. 民族意识的觉醒：随着外族入侵和国家危机的加深，爱国情怀和民族意识逐渐觉醒。文天祥、陆秀夫等忠义烈士的事迹激励着一代又一代人。同时，郑成功收复台湾、戚继光抗倭等英雄事迹也反映了强烈的民族自豪感。

综上所述，明清之际的思想家们在历史转折的关键时刻，以其深刻的洞察力和卓越的智慧，为中国古代思想文化的发展做出了重要的贡献。他们的进步思想不仅在当时产生了积极的影响，而且对后世的改革运动和社会发展提供了宝贵的思想和理论资源。